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    ¡Ya puede empezar a crear cursos!

    Moodle es un sistema de gestión de aprendizaje de código abierto que permite a los educadores crear y administrar cursos en línea. Ofrece una variedad de herramientas y recursos para organizar el material del curso, crear actividades y cuestionarios, alojar discusiones en línea y hacer un seguimiento del progreso de los estudiantes.

    La plataforma es altamente personalizable y puede adaptarse a las necesidades específicas de cada institución o curso. Esto significa que los educadores pueden crear cursos que se ajusten a sus objetivos y metodologías, y personalizarlos para el aprendizaje de cada estudiante. Moodle también admite tanto entornos de aprendizaje síncronos como asíncronos, lo que permite a los educadores organizar eventos en vivo y proporcionar recursos para el aprendizaje a su propio ritmo.

    Moodle es ampliamente utilizado en instituciones educativas de todo el mundo, desde escuelas primarias hasta universidades. También es popular en programas de formación profesional y empresarial. Además, la plataforma es accesible para usuarios de diferentes habilidades y necesidades, lo que la hace inclusiva para todos los estudiantes.

    La comunidad de Moodle es activa y diversa, compuesta por educadores, desarrolladores y usuarios de todo el mundo. La comunidad contribuye al desarrollo y mejora continua de Moodle, y proporciona soporte, recursos y documentación para los usuarios. La plataforma también ofrece una gran cantidad de recursos y herramientas para mejorar la experiencia de los usuarios y fomentar la colaboración y el aprendizaje interactivo.

    Enlaces de interés:


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Cursos disponibles

Virtual Screening usando Autodock Vina

En el presente curso aprenderás a realizar un Cribado virtual de moléculas para la selección de una molécula o ligando (Hit) con posible actividad sobre un blanco terapéutico (proteína) usando un software de docking robusto y potente, Autodock Vina.  Aprenderás a usar diferentes bases de datos de moléculas de las cuales puedes extraer una gran cantidad de ligandos para su evaluación por computadora y hacer un cribado o filtrado con la finalidad de elegir la mejor o mejores contra un blanco terapéutico. En el curso se da una descripción detallada y se va guiando al estudiante paso a paso desde la selección de las moléculas a evaluar, el blanco molecular así como su preparación, evaluación y selección del mejor ligando. El curso esta diseñado para Windows y Linux.

Curso: Química Cuántica II

En este curso adquirirás conocimientos formativos de la química cuántica avanzada para comprender el comportamiento de los átomos y moléculas matemáticamente a nivel sub-atómico (electrones), lo cual permite estudiar las moléculas con herramientas computacionales determinando distintas propiedades químico-estructurales.

curso de LINUX y PYTHON en BIOINFORMÁTICA

Aprende a manejar el sistema operativo LINUX en tu computadora y/o de forma remota, además en este curso aprenderás PYTHON y BIOPYTHON aplicado al análisis de información biológica con enfoque BIOINFORMÁTICO, QUIMIOINFORMÁTICA, además para programar en R y PERL todo esto de la mano de informáticos expertos en la temática.

Diplomado en Docking y Dinámica Molecular

En este diplomado el alumno aprenderá conceptos de estructura de proteínas de 1D-4D, el alumnos manejara conceptos de interacciones ligando-proteína no covalentes, aprenderá a realizar estudios de acoplamiento molecular así como estudios de dinámica molecular de proteínas con ligando, en un entorno de membrana, etc. Es un diplomado de bioinformática estructural teórico-práctico desarrollado de la mano de un profesor-investigador experto con publicaciones científicas Internacionales.

Curso: Acoplamiento molecular (docking) Proteína-Ligando con ADFR

En este curso aprenderás a preparar archivos y hacer análisis de resultados de acoplamiento molecular proteína-ligando mediante la plataforma ADFR (AutoDock for Flexible Receptors), programa  sucesor de Autodock y Autodock vina.

Curso Diseño de Primers (iniciadores)

En este curso el alumno aprenderá a diseñar sus primers o iniciadores, además de revisar conceptos sobre los pesos moleculares en geles así como el manejo de herramientas bioinformáticas para diseño y análisis.

Análisis de mercado y patentes en química medicinal

Aprenderás a identificar oportunidades de negocio, evaluar la competencia y comprender mejor el panorama de la propiedad intelectual en la industria farmacéutica. Te guiaremos a través de ejemplos prácticos y casos de estudio, brindándote las herramientas necesarias para tomar decisiones informadas en tu investigación y desarrollo de productos.

Química Cuántica I

Objetivo: adquirir los conocimientos formativos de la Química Cuántica para comprender el comportamiento de los átomos y moléculas matemáticamente, lo cual permite comprender que hacen las computadoras para estudiar las moléculas con las distintas herramientas computacionales.

Predicción de estructura 3D de proteínas "in silico"

Es un curso que te dará conceptos y y práctica sobre estructura primaria, secundaria y terciara de proteínas, aprenderás a buscar secuencias, a usar herramientas bioinformáticas para construir estructuras 3D. Además aprenderás conceptos y manejo de herramientas para realizar evaluación de estructural. La práctica la realizaras tu mismo en tu computadora con acceso remoto a servidores, instalación de herramientas en tu máquina, etc. 

Curso de visualización y modelado de proteínas (docking) con UCSF Chimera

En este curso aprenderás a visualizar proteínas en estructura primaria (secuencias) y en tercera dimensión para análisis de alineamiento múltiple, análisis de datos estructurales así como su aplicación en acoplamiento molecular (docking) usando herramientas computacionales gratuitas en los tres principales sistemas operativos. Todo esto mediante UCSFChimera.

curso: Modelado Molecular

Es un curso que ofrecerá conceptos sobre bioinformátca estructural que va desde conceptos de  grupos funcionales, estructura de proteínas, además de ver conceptos sobre mecánica molecular, mecánica cuántica, acoplamiento molecular o docking ligando-proteína, proteína-proteína, plegamiento de proteínas, dinámica molecular.

DIPLOMADO EN INVESTIGACIÓN CUANTITATIVA CON RSTUDIO

La mayoría de estudiantes e investigadores presentan dificultades al momento de elegir y aplicar el método estadístico para su investigación, de manera que los resultados obtenidos no responden a los objetivos establecidos. El presente diplomado desarrolla de forma asincrónica la recolección, organización, elaboración de hipótesis y pruebas estadísticas con el programa Rstudio e interpretación adecuada. El desarrollo del curso se da a través de ejemplos directos en posibles investigaciones o similares a realizar

curso: Quimioinformática aplicada al diseño de fármacos

La Quimioinformática es una de las disciplinas que se ha convertido en un pilar durante el desarrollo y diseño de nuevos fármacos y, por lo tanto, indispensable en el menester de la Química Farmacéutica. Esta área del conocimiento permite resolver problemas en el manejo y presentación de información en química mediante la integración de diferentes conceptos, técnicas y métodos computacionales.

Curso: Diseño de plásmidos

Las aplicaciones de la biotecnología moderna se fundamentan en gran medida en conocer las bases de las ciencias ómicas, tales como genómica, transcriptómica, y proteómica. Todo ello ha sido posible por la comprensión y optimización de dichos conocimientos, de los cuales se puede destacar el estudio de la genética de los plásmidos.

Curso: minería de datos en Rstudio

En este curso de minería de datos en Rstudio aprenderás a instalar y manejar los comandos básicos de programación en R, no te pierdas este interesante e importante curso, muy útil hoy en día para manejo masivo de datos aplicado a la minería de datos. 

Curso de Conceptos básicos y aspectos regulatorios de metodologías QSAR

Los estudios de relaciones Cuantitativas Estructura - Actividad (QSAR) tienen como objetivo la búsqueda de correlaciones entre descriptores moleculares y actividades químicas o biológicas para la predicción de las mismas en compuestos desconocidos. Un modelo validado supera el vínculo casuístico entre descriptores y actividades, y se convierte en una herramienta predictiva.

Objetivos:

- Conocer los fundamentos técnicos y científicos de un estudio QSAR.

- Conocer aspectos regulatorios de las metodologías QSAR

Diplomado en Métodos de Estructura Electrónica

Introducción
Este diplomado está diseñado para proporcionar los conocimientos básicos necesarios para realizar cálculos computacionales en química. El objetivo es capacitar a los estudiantes para que puedan obtener resultados confiables en la modelización y simulación de sistemas químicos, basándose en una sólida comprensión teórica y en la aplicación práctica de software especializado.

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Objetivos del Diplomado
Comprender la teoría fundamental: Proveer una base teórica sobre el funcionamiento de los programas de cálculo de estructura electrónica.
Aplicación práctica: Realizar cálculos computacionales usando software libre para el aprendizaje.
Obtención de resultados confiables: Enseñar a interpretar los resultados obtenidos y su relevancia en la química computacional.
Propiedades y reactividad química: Calcular propiedades químicas, reactividad y termoquímica de diferentes sistemas químicos.

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Contenido del Diplomado

1. Fundamentos Teóricos
   - Introducción a la Química Computacional.
   - Principios de la Mecánica Cuántica y su aplicación en cálculos computacionales.
   - Métodos de estructura electrónica: Teoría del Funcional de la Densidad (DFT), Métodos Ab Initio, etc.
   - Conceptos básicos de reactividad y propiedades químicas.

2. Aplicación Práctica
   - Introducción al uso de software libre para cálculos computacionales.
   - Configuración y ejecución de simulaciones.
   - Análisis e interpretación de resultados.
   - Casos de estudio: propiedades y reactividad de moléculas sencillas y complejas.

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Metodología

- Clases teóricas: Explicaciones detalladas de los conceptos fundamentales.
- Ejercicios y casos prácticos: Aplicación de los conocimientos adquiridos en problemas reales.

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Software Utilizado Libre (se ajustará a las necesidades)

-GAMESS
- ORCA
- NWChem
- Avogadro

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Requisitos

- Conocimientos básicos en química y física.
- Familiaridad con conceptos de matemáticas y programación es deseable, pero no indispensable.

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Duración y Modalidad
- Duración: 3 meses 
- Modalidad: Online, con sesiones en vivo (si así se desea) y materiales disponibles para autoaprendizaje.

Métodos estadística aplicados a la investigación con Rstudio

La mayoría de estudiantes e investigadores presentan dificultades al momento de elegir y aplicar el método estadístico para su investigación, de manera que los resultados obtenidos no responden a los objetivos establecidos. El presente curso asincrónico pretende guiar en la elaboración de hipótesis y objetivos a partir de métodos multivariados así como su manejo estadístico con el programa Rstudio e interpretación adecuada. El desarrollo del curso se da a través de ejemplos directos en posibles investigaciones o similares a realizar.

curso Principios de la OECD para el desarrollo de modelos QSAR

La aplicación y la pertinencia de un modelo QSAR se basa en el conjunto de elementos empleados para la obtención de la correlación y en los métodos estadísticos para evaluarlo. La correcta selección de los conjuntos moleculares para la generación del modelo QSAR resulta de suma importancia en la validación de este, ya que debe guardar relación con el espacio químico bajo estudio. Esta serie de cursos tienen como objetivo brindar las herramientas necesarias para determinar la aplicación, la pertinencia y calidad de un estudio QSAR.

Objetivos:

- Familiarizar al participante con los principios de la OECD para el desarrollo de modelos QSAR

- Conocer los principales programas computacionales utilizados en el desarrollo de modelos (Q)SAR.

curso de DOCKING PROTEÍNA-PROTEÍNA

Este curso te permitirá aprender conceptos de bioinformática estructural (proteínas) para poder hacer práctica en servidores online. De esta manera serás capaz de hacer un estudios de docking proteína-proteína de forma teórica y práctica, todo esto desde tu computadora. Además aprenderás a describir las interacciones no covalente de reconocimiento proteína-proteína.   

Curso de Dinámica Molecular Proteína-Agua

En este curso se aboradan conceptos de secuencias y estructura de proteínas (construcción y búsqueda), campos de fuerza (force fields), preparación de archivos para correr una dinamica molecular, hacer la simulación usando el programa NAMD en su computadora y análisis de los resultados con VMD y el programa CARMA. 

Curso de Bioinformática General

En este curso se abordaran temas de informática (arquitectura de computadoras, sistemas operativos, PERL). Además se abordaran temas de alineamiento de secuencias, arboles filogenéticos, predicción de genes, SNPs (análisis poblacional). 

Dinámica Molecular Proteína-membrana

acerca del curso

Este curso te permitirá aprender conceptos sobre estructura de proteínas, además de la importancia de las proteínas en un entorno lipídico para todas aquellas proteínas transmembranales, harás ejercicios para insertar la proteína en membrana y correr una dinámica de un sistema con estas características además de analizar tus resultados cómo RMSD, Rg, RMSF, interacciones no covalentes proteína, cambios conformacionales, etc. Para realizar este curso se requiere tener conocimientos en estructura terciaria de proteínas, conocimientos en membranas lipídicas, manejo básico de linux en modo texto. 

Curso de de R básico

En este curso de R aprenderás a instalar y manejar los comandos básicos de programación en R, no te pierdas este interesante e importante curso, muy útil hoy en día para manejo masivo de datos, es una herramienta gratuita de programación con gran uso potencial en bioestadística, bioinformática de secuencias, bioinformática estructural, datos de omics (metabolómica, lipidómica, proteómica etc), big data etc.  

curso de Dinámica Molecular Proteína-Ligando

Este curso te permitirá aprender conceptos sobre estructura de proteínas, ligandos, campos de fuerza, e interacciones no covalentes proteína-ligando, cambios conformacionales, preparar tu sistema para correr dinámica molecular proteína-ligando, correr tu simulación, analizar tus resultados cómo rmsd, Rg, rmsf, interacciones no covalentes proteína-ligando, calculó de energía, etc.

Métodos de Estructura Electrónica

Métodos de Estructura Electrónica

Descripción del curso:

Este curso ofrece una comprensión profunda de la estructura electrónica tanto a nivel atómico como molecular. Los estudiantes aprenderán los fundamentos de los métodos aproximados utilizados en química computacional y cómo aplicarlos para realizar cálculos computacionales. Al finalizar el curso, los participantes serán capaces de:

  • Determinar geometrías óptimas de moléculas y complejos atómicos.
  • Calcular energías electrónicas con precisión.
  • Evaluar y predecir propiedades moleculares esenciales.

Objetivos del curso:

  1. Comprender la estructura electrónica:

    • Fundamentos de la teoría de la estructura electrónica.
    • Diferenciación entre estructuras atómicas y moleculares.

  2. Métodos aproximados en química computacional:

    • Introducción a los métodos de Hartree-Fock y DFT (Teoría del Funcional de la Densidad).

  3. Cálculos computacionales:

    • Uso de software especializado para realizar cálculos de química computacional gratuito.
    • Determinación de geometrías moleculares óptimas.
    • Cálculo de energías electrónicas.

  4. Propiedades moleculares:

    • Predicción y análisis de propiedades físicas y químicas.
    • Interpretación de resultados computacionales para aplicaciones prácticas.

Acoplamiento molecular (docking) Proteína-Ligando

En este curso el alumno aprenderá conceptos de diseño y tamizaje de fármacos usando quimioinformatica (ADMET), se revisan conceptos de química orgánica básica para ver grupos funcionales, interacciones no covalentes, campos de fuerza y se hará ejercicio para preparar archivos y correr simulación de docking con autodock y hacer análisis de resultados.

15.-ACTIVIDAD FINAL

addactividades

Inmunoinformática y nanovacunas

En este curso el alumno aprederá conceptos de inmunología básica focalizado en desarrollo de vacunas epitopicas por inmunidad humoral y celular. Se revisaran conceptos de estructuras de proteínas. Además se hará práctica con la proteína Spike de COVID19 para identificar regiones inmunogénicas. Para esto se usarán predictores de epitopes lineales y conformacionales para MHC-I y MHC-II, se harán estudios de acoplamiento molecular con MHC. Además se dejará ejercicio asistido para hacer acoplamiento con nanopartícula, en este caso el dendrímero PAMAM-G4.